法拉利 599 限量版有多個版本，其中法拉利 599 SA Aperta 全球限量 80 臺，國內有 3 臺。

法拉利 599 GTO 全球限量 599 臺，國內不過十幾臺。

法拉利 599 GTB 60F1 Alonso Final Edition 全球限量 40 臺，國內保有量個位數。

599 SA Aperta 是為紀念賓尼法利納誕辰 80 周年打造，向 Scaglietti 和 Andrea Pininfarina 表達敬意。從外觀來看，599 SA Aperta 與普通硬頂版 599 基本一致，但采用更低矮傾斜的前風擋玻璃和更低的車身懸掛，敞篷為軟頂折疊設計。它基于 599 開發(fā)，底盤高度降低，因軟頂敞篷設計車身剛性變強。動力方面，搭載 6.0 升 V12 自然進氣引擎，最大馬力可達 670HP，百里加速成績僅需 3.6 秒，極速上看 330km/hr。

599 GTO 是 599 GTB 的高性能版本，采用大量碳纖維材料，引擎設計用了賽道版的 599XX，排量 5.9，V12 引擎，馬力 670 匹，扭矩 620。

599 GTB 60F1 Alonso Final Edition 于 2011 年推出，是為紀念費爾南多·阿隆索在 F1 意大利站奪冠，距離弗洛伊蘭·岡薩雷斯駕 375 F1 賽車在 1951 年英國銀石賽道奪冠 60 周年。這臺車經歷 3 次過戶，里程低，內飾是典型賽車式風格，搭載 6.0 升 V12 自然吸氣發(fā)動機，最大功率 620 馬力，最大扭矩 608 牛米，變速箱是 6 擋 AMT，前置后驅，0-100km/h 加速 3.7 秒。