有權(quán)使用駕駛證檔案查詢系統(tǒng)的部門主要是公安機關(guān)交通部門，具體包括人民法院、人民檢察院、公安機關(guān)或者其他行政執(zhí)法部門、紀檢監(jiān)察部門以及公證機構(gòu)、仲裁機構(gòu)、律師事務(wù)所。

這些部門因辦案需要查閱機動車駕駛證檔案時，應(yīng)當出具公函和經(jīng)辦人的工作證。

機動車駕駛?cè)瞬樵儽救藱n案的，應(yīng)當出具身份證明和機動車駕駛證。比如人民法院在審理案件時，為了獲取相關(guān)證據(jù)，可憑公函和工作證使用查詢系統(tǒng)。

檢察院在履行監(jiān)督職責過程中，若涉及駕駛證相關(guān)問題，也有此權(quán)限。

公安機關(guān)在處理交通違法、事故等執(zhí)法活動中，同樣能使用該系統(tǒng)。行政執(zhí)法部門在執(zhí)行公務(wù)時，若與駕駛證信息有關(guān)，依規(guī)也可查詢。紀檢監(jiān)察部門為了調(diào)查違規(guī)違紀行為，在必要情況下可以使用。

公證機構(gòu)、仲裁機構(gòu)、律師事務(wù)所因辦案需要查閱機動車駕駛證檔案的，應(yīng)當出具公函和經(jīng)辦人的工作證。

總之，只有特定的這些部門在符合規(guī)定的條件下，才有權(quán)利使用駕駛證檔案查詢系統(tǒng)，以保障查詢的合法性和必要性，保護公民的個人信息安全。